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臨床檢測中ctDNA的意義,德國MB核酸污染祛除助力科研

更新時間:2023-08-03  |  點擊率:685

隨著核酸檢測技術(shù)的發(fā)展,疾病檢測技術(shù)也得以發(fā)展。核酸實驗中即使只有一個污染的DNA分子被檢測到,也會使整個PCR檢測過程出現(xiàn)誤差。為確保PCR試驗數(shù)據(jù)準確,預防DNARNA交叉污染,PCR實驗室大多會常備DNA/RNA污染清除劑。PCR Clean可有效地降解大多數(shù)表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴增子,質(zhì)?;蚧蚪MDNARNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。

 

在過去的20年里,癌癥存活率一直在不斷提高,這在很大程度上歸功于更有效的治療和改進的患者管理策略。細化識別患者誰可能受益于輔助治療后明確的管理是優(yōu)化患者護理的關(guān)鍵。由于適當?shù)母深A可以改善預后,明智地使用額外的治療可以使復發(fā)風險低的患者免受不良治療效果和不必要的費用。

 

目前的疾病管理模式以腫瘤特異性、分期為基礎的建議為中心,主要依靠病理和影像學結(jié)果來優(yōu)化患者的治療計劃。雖然影像學是監(jiān)測疾病進展或復發(fā)以及衡量治療反應的標準方法,但放射學結(jié)果有時難以正確解釋,導致假陽性和陰性的高發(fā)生率。基于血液的代謝腫瘤標志物(如癌胚抗原(CEA)、癌抗原(CA)-125、CA19-9和乳酸脫氫酶(LDH))是評估疾病狀態(tài)的一種非侵入性方法。然而,許多這些已建立的生物標志物被認為是不可靠的,因為它們可能由于與癌癥無關(guān)的疾病而升高,導致低靈敏度和特異性。

 

ctDNA已經(jīng)成為一種非侵入性的、基于血液的生物標志物,廣泛反映了腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)的體細胞變異。已經(jīng)開發(fā)了幾種測量ctDNA的方法,例如基于小組的測定,下一代測序和液滴數(shù)字聚合酶鏈反應,并在其他地方進行了深入討論。除了每種腫瘤類型固有的生物學差異之外,每種檢測的潛在ctDNA檢測方法和分析驗證措施(如敏感性和特異性)的差異也會影響對結(jié)果的后續(xù)解釋。無論采用何種檢測方法,在臨床解釋ctDNA結(jié)果時,也應考慮通過變異等位基因分數(shù)(作為百分比)或腫瘤分數(shù)(作為每毫升腫瘤分子的平均數(shù)量)來定量測量循環(huán)腫瘤負荷。ctDNA有多種應用,包括早期癌癥檢測、用于治療選擇的綜合基因組分析、分子殘留病(MRD)檢測、復發(fā)監(jiān)測和治療反應監(jiān)測。這些臨床應用的適當測定可能會有所不同,這取決于在特定的臨床場景中必須評估什么。

 

臨床研究已經(jīng)證實ctDNA檢測及其濃度與腫瘤負荷、治療反應和預后之間存在關(guān)聯(lián)。使用不同分析技術(shù)的大量研究表明,ctDNA是一種敏感和特異性的MRD檢測生物標志物。它可能比放射成像和其他標準護理(SOC)方法早幾個月,但最好與標準監(jiān)測診斷結(jié)合使用。然而,目前對ctDNA臨床應用的了解僅限于主要是觀察性或軼事性質(zhì)的研究,并且僅限于特定適應癥。有必要檢查基于ctdnaMRD檢測在跨適應癥的介入性試驗中的臨床應用。目前這類臨床試驗的研究結(jié)果已經(jīng)在之前的文獻中進行了回顧。最后,目前只有少數(shù)基于ctdnaMRD檢測方法可供臨床醫(yī)生商業(yè)化使用,每種方法都具有不同程度的預測和預后價值。因此,盡管ctDNA在癌癥患者中的應用的現(xiàn)有數(shù)據(jù)很有希望,但至關(guān)重要的是,訂購提供者了解這種新型生物標志物的含義、優(yōu)勢和局限性,以便將結(jié)果最佳地應用于臨床實踐。

 

研究人員對ctDNA進行優(yōu)化,用于實體腫瘤MRD檢測。研究人員還強調(diào)了ctDNA如何幫助指導癌癥患者在其疾病過程中的臨床管理。

 

相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標題為:“Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making"。

 

ctDNA檢測在血液學惡性腫瘤中的應用和效用先前已經(jīng)討論過。早期癌癥檢測的篩查方法也會檢查游離DNA (cfDNA),盡管也會分析其他特征(例如甲基化)。初步數(shù)據(jù)表明這種篩檢的臨床效用,但它們不是用于監(jiān)測疾病進展的,因此不包括在本討論中。本篇研究中,研究人員首先討論在手術(shù)或最終治療之前和之后ctDNA結(jié)果的解釋。然后研究人員討論了當ctDNA檢測用于MRD時的技術(shù)考慮。科研人員對完成SOC治療后ctdna陽性和陰性患者的處理提出建議。最后,本篇文章討論了ctDNA檢測在新輔助治療中治療反應監(jiān)測的應用,特別是在免疫治療的背景下。在所有情況下,評估ctDNA的結(jié)果都應該在對患者進行更大范圍的綜合評估的背景下進行,從而完善標準的臨床分期和風險分層。


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